1. Доходы налогоплательщика могут быть отнесены к доходам от источников в Российской Федерации или к доходам от источников за пределами Российской Федерации в соответствии с главами "Налог на прибыль организаций", "Налог на доходы физических лиц" настоящего Кодекса.
2. Если положения настоящего Кодекса не позволяют однозначно отнести полученные налогоплательщиком доходы к доходам от источников в Российской Федерации либо к доходам от источников за пределами Российской Федерации, отнесение дохода к тому или иному источнику осуществляется федеральным органом исполнительной власти, уполномоченным по контролю и надзору в области налогов и сборов. В аналогичном порядке в указанных доходах определяется доля, которая может быть отнесена к доходам от источников в Российской Федерации, и доли, которые могут быть отнесены к доходам от источников за пределами Российской Федерации.
Положения комментируемой статьи устанавливают правило, по которому ответ на вопрос об источниках доходов налогоплательщика (РФ или иностранное государство) решается применительно к НДФЛ и налогу на прибыль по правилам, установленным соответствующими главами второй части НК РФ.
При этом, если налогоплательщик, исходя из соответствующих положений НК РФ, не может определить, относятся ли полученные им доходы к доходам от источников в РФ либо к доходам от источников за пределами РФ, вопрос отнесения таких доходов к тому или иному источнику осуществляется уполномоченным органом.
Аналогичные разъяснения приведены в письме Управления ФНС России по г. Москве от 16.08.2006 N 20-12/72974.
В решении Арбитражного суда г. Москвы от 12.02.2007, 14.02.2007 N А40-20833/06-117-173 указано, что российская организация, выплачивающая иностранной компании доходы от транспортно-экспедиторских услуг, не является в этом случае налоговым агентом и не должна при каждой выплате таких доходов удерживать налог и перечислять его в федеральный бюджет на основании пункта 1 статьи 42 НК РФ.
